Visi dan misi pembangunan Desa Kotajin menyatu pada visi dan misi Kabupaten Gorontalo Utara. Visi dan misi pengbangunan Desa Kotajin sesuai dengan masa jabatan Kepala Desa berlaku mulai Tahun 2023 sampai dengan 2028, yaitu:
Visi
Mengembangkan Potensi Desa Kotajin Sebagai Desa Mandiri dan Kawasan Bisnis/Jasa Berbasis Teknologi Ramah Lingkungan, Sejahtera, Indah, Manarik dan Berbudaya.
Misi
1. Melakukan penataan lingkungan melalui program tata ruang desa yang asri, indah dan menarik;
2. Meningkatkan kualitas pelayanan kesehatan di desa melalui gerakan desa sehat;
3. Meningkatkan kesadaran hukum masyarakat melalui program masyarakat cerdas dan sadar hukum;
4. Meningkatkan kualitas pendidikan baik formal maupun non formal melalui gerakan kampung cerdas;
5. Meningkatkan hasil produksi kuliner masyarakat melalui program usaha mandiri;
6. Menanamkan nilai-nilai religious dan kearifan lokal melalui program pengembangan niai-nilai spiritual dan adat istiadat;
7. Mengedepankan kejujuran dan musyawarah mufakat dalam kehidupan sehari-hari, baik dengan pemerintah maupun dengan masyarakat desa;
8. Meningkatnya perekonomian dan kesejahteraan warga desa;